Профессор Райан Чой, также известный как супергерой Атом (учёный, умеющий уменьшаться до микроскопических размеров), впервые посещает легендарный Зал Справедливости. Там он знакомится с основными членами Лиги: серьёзным Бэтменом, добродушным Суперменом, могущественной Чудо-женщиной, а также с их верными питомцами — псом Бэтмена Эйсом и суперпсом Супермена Крипто.
К компании присоединяются и другие герои с необычными способностями: эластичный Пластикмен и ядерный человек Огненный Шторм. Все они тепло встречают Атома и приглашают его официально вступить в ряды Лиги Справедливости, впечатлённые его научным умом.
Однако праздничную атмосферу нарушает срочный сигнал тревоги. Лоис Лэйн сообщает, что в Метрополисе начался хаос. Главный зачинщик — Джокер. Он атаковал город своим фирменным «смехотворным газом», от которого жители не могут перестать смеяться и теряют способность что-либо делать. Цель Джокера — добраться до здания газеты «Дейли Планет» и «преобразить» его во что-то ужасно смешное и разрушительное.
Бэтмен немедленно отправляет экстренный вызов самому быстрому герою на планете — Флэшу. Вся Лига Справедливости, включая новичка Атома, мчится в Метрополис, чтобы остановить Джокера. Но в погоне за Принцем преступного мира Флэш случайно пробегает так быстро, что нарушает временной континуум, что приводит к ещё большим проблемам и появлению альтернативных версий реальности. Теперь героям придётся не только остановить Джокера, но и разобраться с последствиями вмешательства в время, объединившись, чтобы восстановить порядок в настоящем, прошлом и будущем. Фильм в духе LEGO сочетает экшен, юмор и хаос, показывая команду героев в самом нелепом и весёлом свете.