«Мальчик по имени Ха» — японская семейная драма о взрослении, действие которой разворачивается в Кобе накануне и во время Второй мировой войны. Главный герой — Хадзимэ Сэно, которого друзья зовут просто Ха. В начале истории он совсем ребёнок, любознательный и склонный задавать неудобные вопросы о том, что происходит вокруг. Ему не всегда легко понять взрослые правила и ожидания, но он старается разобраться в том, кто прав и что правильно.
Ха растёт в христианской семье: его отец держит портняжную мастерскую, а мать глубоко верующая и стремится привить детям свои убеждения. Они живут обычной жизнью до тех пор, пока по всей стране не усиливаются националистические настроения, и мир вокруг начинает меняться. Ха наблюдает, как все больше требований и ограничений навязывается обычным людям — школе, работе, соседским разговорам — и учится реагировать на это по‑своему.
Позже события разворачиваются на фоне реальных исторических перемен: усиливается военная пропаганда, вводятся обязательные военные тренировки для молодёжи, а привычная жизнь сталкивается с нехваткой свободы и растущим давлением со стороны государства. Через этот хаос режиссёры показывают, как для семьи Ха наступают трудные времена.
Хотя фильм основан на автобиографической книге, он рассказывает не только о войне, но и о том, как на ребёнка влияют чужие идеологии, ожидания взрослых и стремление найти своё место в мире. Ха наблюдает за тем, как рушатся старые устои, какие моральные дилеммы возникают перед людьми и как эти изменения отражаются на его собственных взглядах на жизнь.