То, что должно было стать обычным романтическим отпуском Элис Монро во Франции, быстро выходит из‑за рамок привычного. Элис — американская археолог, которая живёт на чемоданах, раз за разом меняя города и страны. С ней Том Паркер, её парень, идеальный спутник и человек, которому она доверяет больше всего на свете. Они уже много лет строят свои отношения между перелётами, полями археологических раскопок и благотворительными миссиями, но на этот раз путешествие должно было стать чем‑то другим — шансом подумать о будущем.
Пара садится на поезд в Париже и направляется на юг — к Арлю, в маленький город, о котором Элис давно мечтала. Том выходит из купе на минуту, чтобы ответить на телефонный звонок, и исчезает. Он просто пропадает: нет ни звонка, ни сообщения, ни следа — будто его никогда и не было рядом. Люди вокруг растеряны, и никто точно не объясняет, что произошло.
Элис привязана к Тому не только чувствами, но и воспоминаниями, и она отказывается принять спокойное объяснение о том, что он мог просто уйти. Сначала она пытается разобраться через официальные каналы — у проводника и в полиции — но сталкивается с равнодушием и скепсисом. Французские полицейские советуют подождать положенные часы, а люди в пути бросают уклончивые взгляды.
Оставшись одна в чужой стране, Элис начинает копаться в деталях его жизни. Таинственная женщина, с которой они познакомились в поезде, предлагает помощь переводчика, но вскоре оказывается, что у этой женщины есть собственные мотивы. Постепенно Элис узнаёт, что некоторые вещи в прошлом Тома не совсем такие, какими они казались, и её спокойное путешествие превращается в цепочку допущений, срывов и сомнений.
Сериал рассказывает о том, как один человек может оказаться едва знакомым даже тому, кого он любит, и как непросто бывает отделить правду от иллюзии. «Исчезнувший» ведёт зрителя от туристических улочек Парижа к марсельским переулкам и заставляет спрашивать не только о том, что случилось с Томом, но и о том, насколько хорошо мы знаем друг друга.